Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgms2Q9D4B1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms