Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UvssaQ9D479 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UvssaQ9D479 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms