Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms