Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Trappc6bQ9D289 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trappc6bQ9D289 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trappc6bQ9D289 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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