Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms