Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tspan11Q9D1D1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms