Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cyc1Q9D0M3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyc1Q9D0M3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyc1Q9D0M3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyc1Q9D0M3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyc1Q9D0M3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyc1Q9D0M3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyc1Q9D0M3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyc1Q9D0M3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyc1Q9D0M3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyc1Q9D0M3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyc1Q9D0M3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyc1Q9D0M3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyc1Q9D0M3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyc1Q9D0M3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyc1Q9D0M3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyc1Q9D0M3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms