Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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