Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms