Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mdm1Q9D067 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mdm1Q9D067 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms