Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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