Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms