Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nsfl1cQ9CZ44 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nsfl1cQ9CZ44 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms