Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Yif1bQ9CX30 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms