Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prkrip1Q9CWV6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkrip1Q9CWV6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms