Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ddx28Q9CWT6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ddx28Q9CWT6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ddx28Q9CWT6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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