Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6kQ9CWP4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms