Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx2Q9CWK8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms