Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhobtb3Q9CTN4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms