Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms