Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klhl28Q9CR40 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms