Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR16

Ppid, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpidQ9CR16 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpidQ9CR16 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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PpidQ9CR16 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PpidQ9CR16 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PpidQ9CR16 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PpidQ9CR16 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PpidQ9CR16 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpidQ9CR16 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms