Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931417E11RikQ9CR05 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms