Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQM1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQM1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQM1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQM1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQM1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQM1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms