Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Higd2aQ9CQJ1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Higd2aQ9CQJ1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms