Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CQC3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CQC3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms