Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pole4Q9CQ36 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pole4Q9CQ36 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms