Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scd3Q99PL7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms