Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GpnmbQ99P91 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms