Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcg3Q99P81 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms