Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms