Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Acss1Q99NB1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms