Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms