Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tdrd1Q99MV1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms