Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms