Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcbtb2Q99LJ7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rcbtb2Q99LJ7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rcbtb2Q99LJ7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rcbtb2Q99LJ7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rcbtb2Q99LJ7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rcbtb2Q99LJ7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms