Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms