Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms