Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms