Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctu1Q99J10 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ctu1Q99J10 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ctu1Q99J10 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctu1Q99J10 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms