Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms