Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms