Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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Afg3l1Q920A7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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Afg3l1Q920A7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Afg3l1Q920A7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Afg3l1Q920A7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Afg3l1Q920A7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Afg3l1Q920A7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Afg3l1Q920A7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Afg3l1Q920A7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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