Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smarca5Q91ZW3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smarca5Q91ZW3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms