Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp6Q91WS2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp6Q91WS2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms