Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dkk4Q8VEJ3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dkk4Q8VEJ3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms