Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fyco1Q8VDC1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms