Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Z9

Pom121, Nuclear envelope pore membrane protein POM 121, mousemouse

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pom121Q8K3Z9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pom121Q8K3Z9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pom121Q8K3Z9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pom121Q8K3Z9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pom121Q8K3Z9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pom121Q8K3Z9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pom121Q8K3Z9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pom121Q8K3Z9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pom121Q8K3Z9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pom121Q8K3Z9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pom121Q8K3Z9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms