Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MyripQ8K3I4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MyripQ8K3I4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms