Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms